La procédure commence chez le chercheur qui doit expliquer pourquoi l'expérimentation animale est nécessaire, quel est le bénéfice escompté par la recherche et quelles seront les contraintes infligées à l'animal. La commission cantonale pour l'expérimentation animale examine la demande, éclaircit les questions éventuelles avec les chercheurs et émet finalement une recommandation : refus, acceptation avec charges (par exemple utilisation de moins d'animaux) ou acceptation. L'autorisation est délivrée par l'office vétérinaire cantonal qui se base sur la recommandation de la commission.